L'église fut construite au XVIe siècle, puis agrandie et restaurée au XVIIIe siècle. Cette reconstruction était nécessaire en raison des ravages causés par le tremblement de terre connu sous le nom de Mandado de Deus (Mandat de Dieu). Sa façade majestueuse est ornée d'un portail, de trois grandes fenêtres et de deux oculus, sans oublier le clocher, atypique pour l'architecture de l'île. À l'intérieur, les sculptures dorées et les nombreuses peintures sont remarquables.

Phare situé à l'extrémité sud-ouest de l'île, plus précisément à Ponta do Topo. Il se compose d'une tour circulaire de 16 mètres de haut et d'annexes abritant les quartiers du gardien et un espace de stockage.

L'église d'origine, probablement fondée au XVIe siècle, fut détruite par un incendie en 1639. Des années plus tard, au XVIIe siècle, une nouvelle église fut construite dans un endroit moins exposé à la force de la mer. En 1757, elle subit d'importants dégâts lors du tremblement de terre du « Mandado de Deus », en 1945 lors d'une importante marée haute, et en 1980, lors d'un autre tremblement de terre.

Cette église est le seul vestige de l'ancien couvent de San Francisco.