Fondé en 1059 selon la tradition populaire, bien que la référence documentaire la plus ancienne remonte à 1099, le monastère de Pombeiro jouissait de privilèges et d'une justice propre dès 1112, comme en témoigne la Charte de Couto accordée à cette date par D. Teresa. Cette institution monastique est documentée depuis 853, ce qui en fait l'une des plus anciennes du territoire, bien qu'il n'y ait aucune preuve matérielle du premier établissement. Situé à l'intersection de deux des routes principales de l'époque médiévale, une qui reliait Porto à Trás-os-Montes et une seconde qui reliait Beira à Alto Minho, le monastère …
En 1147, il a été fondé le couvent de Saint-Vincent, ayant été fourni par d. Afonso Henriques aux chanoines de Saint Augustin. En 1582, a été la démolition du bâtiment original et a commencé la construction de la nouvelle église, un deuxième projet de Filippo Terzi, qui a compté avec la collaboration de Herrera, ayant été passée par Leonardo Torriano, Balthazar Alvarez, Pedro Nunes Tinoco et João Nunes Tinoco. Le 28 août 1629 est célébrée la première messe dans l'église. Le tremblement de terre de 1755 a causé des dommages divers, y compris la destruction du dôme. Entre 1773 et …