Numa plataforma junto ao rio, sobre uma antiga necrópole romana, ainda eram visíveis há umas dezenas de anos as ruínas de uma ermida que a tradição chamava de São Sebastião. A construção da Escola Secundária e de um pavilhão gimnodesportivo motivaram uma intervenção arqueológica que, por sua vez levou a alterar a implantação dos novos equipamentos. Hoje, no local, além de uma parte da necrópole romana que pode ser visitada, está aberta aos visitantes a capela de São Sebastião, completamente reconstruída, onde está exposto o principal espolio exumado.

Convento edificado no século XVII, estando situado numa elevação rochosa. Deste local tem-se vistas para a vila e para o rio Guadiana. Com a extinção das ordens religiosas na década de 30 do século XIX o espaço é votado ao abandono pelas autoridades. Em finais dos anos 70 do século passado o convento é adquirido por particulares que o transformam em sua residência, tendo a igreja sido reservada para concertos, exposições e outras iniciativas culturais. Atualmente, o Convento de S. Francisco é um polo cultural de grande importância para a Vila de Mértola.